1989-1994: Adolf Kacovsky (svájci) – a baseli Old Boys’ Tennis Club edzője, amihez Federer nyolcéves korában csatlakozott. Gyerekkorában Kacovsky volt a legnagyobb hatással a játékára.

1991-1995, 1997-1998: Peter Carter (ausztrál): Carter már az Old Boys’ Club éveiben is foglalkozott Federerrel, majd 10 és 14 éves kora között külön is teniszezett vele heti rendszerességgel. 1997 után Carter lett az edzője egészen addig, amíg Federer el nem kezdett a profik közt versenyezni. A váltás után is szoros maradt a kapcsolatuk, Carter mindvégig támogatta őt.

1995-1997: Miután Federer junior svájci bajnok lett, Ecublensben, a svájci nemzeti teniszközpontban teniszezhetett az iskola befejezéséig. A svájci teniszszövetség támogatta nemzetközi pályafutásának kezdetén.

2000-2003. Peter Lundgren (svéd) – már korábban is segítette Federert, majd mikor a teniszező kikerült a nemzeti teniszszövetség irányítása alól, Lundgrent választotta privát edzőjének, (miközben Peter Carterrel továbbra is rendszeresen konzultált.) A 2003-as év után meglepetésre úgy döntött, Lundgren segítsége nélkül folytatja pályafutását.

2005-2007: Federer felkérte Tony Roche-t tanácsadó edzőnek. Tony Roche időnként, főleg a Grand Slam-tornák, és egyes Masters Series-tornák előtt segítette a felkészülésben. 2007 májusában, alig két héttel a Roland Garros előtt kölcsönös megegyezéssel abbahagyták a közös munkát.

2008-2008: José Higuerasszal, Jim Courier, Michael Chang és Pete Sampras korábbi edzőjével kezd dolgozni. Az együttműködés 2008 végén megszakad.

2009 -2009: Roger a továbbiakban hivatalos edző nélkül dolgozik. De természetesen mellette van erőnléti edzője Pierre Paganini, Gary Hamilton Roger fizióterapeutája és Severin Lüthi, aki edzőpartnereket szervez Rogernek.

2010 augusztus-: Paul Annacone-nal edz a nyáriszünetben, aki korábban Tim Henman és Pete Sampras edzője volt. Paul elkísérte őt a torontói versenyre. Nem sokkal később pedig Roger bejelentette, hogy Paul hivatalosan is az edzője lett.

Kiegészítés:
2002 augusztusában volt edzője és barátja, Peter Carter tragikus halála fordulópontot jelentett karrierjében és a játékhoz való hozzáállásában. Fiatal játékosként sokszor figyelmen kívül hagyta, amit az edzői mondtak neki, hogyan kell játszania és viselkednie, de ekkor volt barátja kedvéért lassan összeszedte magát. Nem sokkal a baleset után Cincinnatiben ugyan még újra kiesett az első körben, és a US Openen is csak a negyedik körig jutott, de aztán megnyerte a bécsi tornát, amit Carternek ajánlott:
„Ezt a címet neki nyertem. Nagyon hiányzik.”